藤原清衡が平泉鎮護の神として五方鎮守総社を建立し、その中の北方鎮護として設置されました。平成20年7月には境内から陶器を焼いた窯跡が3基本発見されました。瓷器（しき）系の陶器窯としては国内最北、東北最古の窯跡と考えられており、藤原氏が平泉で陶器を生産したことを示す貴重な遺構となっています。熊野三社は古くは現在の平泉文化遺産センターの地にあったと言われております。